De samenwerking tussen de partners uit zich in gemeenschappelijke vergaderingen, op het niveau van het Operationele Programma via het , of op het niveau van de deelprogramma’s via .
Daarnaast wordt de uitvoering van het Programma verzorgd door één enkele voor alle partners, en door een dat optreedt onder het gezag van de Programmapartners. In elk gebiedsdeel is er een die de coördinatie van het programma binnen zijn gebied op zich neemt. Hij is in directe relatie met van het programma.
Tevens is er de , eveneens gemeenschappelijk, die instaat voor het beheer en de uitbetaling van de Europese middelen aan de operatoren.
Ten slotte is er nog een , dat uit zes steunpunten (antennes) bestaat en dat als plaatselijke gangmaker voor het Programma optreedt.
